
南農(nóng)合作發(fā)布蘭州百合基因組
本報(bào)訊 10 月 24 日,我校園藝學(xué)院滕年軍教授團(tuán)隊(duì)、薛佳宇副教授團(tuán)隊(duì), 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝林學(xué)學(xué)院寧國貴教授團(tuán)隊(duì)與福建農(nóng)林大學(xué)明瑞光教授團(tuán)隊(duì)等國內(nèi) 10 多家科研團(tuán)隊(duì)聯(lián)合公布了百合高質(zhì)量染色體級(jí)別基因組, 成為世界上首個(gè)正式報(bào)道的最大植物基因組。 相關(guān)文章“The evolutionary tale oflilies: Giant genomes derived from transposon insertions andpolyploidization”發(fā)表在《The Innovation》期刊。
基因組存儲(chǔ)了一個(gè)物種的完整遺傳信息, 是理解其生物學(xué)特性和進(jìn)化歷程的關(guān)鍵。 自然界中,不同生物的基因組揭示了生命之樹上基因組大小的巨大差異, 其中一些植物擁有超大的基因組。 然而,這些超大基因組的起源和形成機(jī)制卻不盡相同。 百合是單子葉百合目百合科多年生植物,因其極高的觀賞、食用與藥用價(jià)值而備受關(guān)注。本研究利用 Nanopore、Illumina 和 Hi-C 測序技術(shù),以及優(yōu)化的組裝方法, 獲得了 36.68 Gb 的蘭州百合超大型基因組,并解析了其形成機(jī)制和特征, 也揭示了鱗莖營養(yǎng)物質(zhì)積累的遺傳基礎(chǔ)。這一成果標(biāo)志著百合的分子研究進(jìn)入新時(shí)代,也是植物基因組學(xué)的重要突破性研究進(jìn)展之一。
我校為該論文的第一署名單位和通訊單位,我校鐘山青年研究員徐素娟博士、已畢業(yè)碩士張心祺、吳玉峰教授,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士生陳潤洲以及上海市農(nóng)科院楊柳燕研究員為論文的共同第一作者;滕年軍、薛佳宇、寧國貴、明瑞光為論文共同通訊作者;北京林業(yè)大學(xué)、海南大學(xué)等單位 20 多位合作者參與本研究。 本研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、江蘇省種業(yè)振興揭榜掛帥項(xiàng)目等資助和我校生物信息學(xué)中心高性能計(jì)算平臺(tái)的支持。
(園藝學(xué)院)